囲み線やルビを設定すると行間が変わる
囲み線やルビを設定すると行間が勝手に空いてしまいますが、そういうものです。
行間をより狭くする場合には[書式]メニューから[段落]で、[行間]を「固定値」にし、[間隔]でポイント数(行間)を指定します。